EmacsのC部分はC99およびそれ以降にたいして可搬性があります。C99以降の‘<stdckdint.h>’や‘[[noreturn]]’のようなC11固有の機能は通常はconfigure時に行われるチェックなしでは使用しておらず、Emacsのビルド手順は必要なら代替えの実装を提供します。C99以降の無名な構造体や共用体のようないくつかのC11機能はエミュレートが非常に困難なので完全に無視しています。
そう遠くない将来のある時点で基本となるC方言は間違いなくC99以降のものに変更されるでしょう。